正常狀態下，人體居存著許多微生物，構成大千的微觀生態世界，維持著機體穩定的生物環境。這是正常機體“百病不侵”的重要原因之一。毛囊皮脂腺中也常住有三組微生物，它們是痤瘡丙酸桿菌、白色葡萄球菌、卵圓形糠秕孢子菌。這三種微生物具有多種生物功能，均可分解脂肪，產生遊離脂肪酸，但以痤瘡丙酸桿菌最為重要。痤瘡丙酸桿菌是毛囊皮脂腺內一種革蘭陰性的厭氧菌, 近中性環境中生長最快，在pH≤5或≥8的環境中則受到抑制。它依賴毛囊中的皮脂特別是甘油三酯作為營養，喜歡在皮脂豐富的環境中繁殖。
兒童痤瘡丙酸桿菌很少，青春期後由於皮脂量的增多，痤瘡丙酸桿菌大量繁殖。它能產生脂質酶、蛋白酶、透明質酸酶及炎性因子。其中脂質酶能將毛囊漏斗部的甘油三酯代謝為遊離脂肪酸，刺激毛囊引起炎症，致使毛囊壁損傷破裂，進而導致剝脫的角化上皮細胞、皮脂和皮脂中的遊離脂肪酸以及痤瘡丙酸桿菌等逸入真皮中，產生以毛囊周圍為主的深部炎症。此外，痤瘡丙酸桿菌還可以作為一種超抗原引起免疫反應，從而繼發炎症。
此外，痤瘡的嚴重程度也可能和痤瘡丙酸桿菌的增殖等因素有關。
因此，區域性微生態的改變與痤瘡的產生、發展和結果都有著密切關係，這是不爭的事實。
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