肝功能異常的原因有幾大類：
1、病毒性肝炎：由嗜肝病毒感染引起，如甲型肝炎、乙型肝炎、丙型肝炎、戊型肝炎，可以檢測血清病毒抗體或病毒核酸DNA或RNA以明確診斷;
2、非酒精性脂肪性肝炎：近年脂肪肝很常見，肝功能也可以受損，在除外病毒性肝炎的情況下，如果患者血脂高，腹部彩超提示脂肪肝，沒有飲酒史，可以考慮非酒精性脂肪性肝炎;
3、酒精性肝炎：在除外病毒性肝炎的情況下，患者有長期大量飲酒史，肝功能GGT,鹼性磷酸酶升高有一定提示作用;
4、自身免疫性肝病：除外病毒性肝炎，又沒有飲酒史，也無脂肪肝，可以檢測免疫球蛋白和自免肝抗體譜以診斷;
5、感染中毒性肝炎：所有的細菌和病毒感染(非嗜肝病毒,如鉅細胞病毒，EB病毒，麻疹病毒等)都可以引起肝功能異常;
6、膽囊結石，膽管結石導致膽道感染，引起梗阻性黃疸，以直接膽紅素升高為主，肝功能GGT和鹼性磷酸酶升高;
7、先天性黃疸，遺傳性肝病;
8、溶血性黃疸，因為紅細胞溶血導致，有貧血表現，可以檢查溶血抗體。
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