嬰幼兒肛瘻發病初期先是肛周膿腫，在肛周鼓起一膿包，區域性紅腫熱痛，膿腫潰破後腫消痛減，破潰口淋漓不斷地流水流膿，外口時閉時潰，外口封閉後內口不閉，就很容易再次感染。膿腫潰破了就是肛瘻。
嬰幼兒肛瘻一般是低位的，有內口(在肛門內)、外口(在肛周面板上的潰口)、管道三部分，內口與外口之間由管道相連。使用肛瘻膏時要將藥物注入肛門內，由於肛瘻管道短注藥後藥膏可能會從肛門溢位，如不用衛生紙將藥膏徹底擦淨，就很容易從肛瘻的外口處灌入管道內，肛瘻膏的作用是讓內口閉合，切斷了感染源，使細菌不能入侵，外口應讓它敞著，使管道內的炎性分泌物能以排洩出，這樣肛瘻的炎症才能慢慢消退，達到治療目的。
如果藥膏注入肛瘻管道內，很容易堵塞管道，使炎性分泌物引流不暢，內口沒有閉時，細菌由此進入就會加重炎症反應。
曾有一女童的直腸陰道瘻用肛瘻膏治療近3個月了，效果明顯，仍在繼續治療。
有時家長會問：肛瘻外口塗什麼藥膏好，我認為外口什麼藥也不要塗，讓其敞著口流分泌物這樣患者就不會有疼痛。肛瘻周圍腫脹時可以在腫脹的外圍及腫脹處塗些消炎散結的藥膏。
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