1、糞便採集時的要求
(1)糞便常規(RT)及隱血(或稱潛血，OB)試驗
用容器內的小勺挑取少許新鮮糞便(約小黃豆大小)，應選擇其中有膿血、黏液的部分或顏色異常部分，如無異常，則可自糞便表面不同部位及糞便深處多部位取材，標本量一般30～50mg，放入乾燥清潔有蓋的塑料盒內1小時內送檢。無糞便而又必須檢查時可經肛門指診獲取糞便。灌腸後的糞便常因過稀及混有油滴等而不適宜檢驗。
(2)糞便寄生蟲檢查標本
檢查阿米巴滋養體應於排便後立即從膿血性或稀軟部分取材，立即送檢。患者在家中留取標本時，送檢過程中應採取保溫措施，因為阿米巴原蟲可在低溫下失去活動力從而不宜查到。檢查蟯蟲卵時，在清晨排便前自肛門四周皺襞處拭取標本，寄生蟲卵標本立即送檢。應連續送檢3天，以避免因某些原蟲或蠕蟲的週期性排卵現象而漏檢。
(3)糞便微生物檢查標本
應採用無菌有蓋容器。普通細菌培養：取有膿血、黏液部分的糞便3g以上，液體糞便取3mL以上置於無菌瓶中，立即送檢。難辨梭菌培養及難辨梭菌毒素檢測：糞便標本應充盈整個無菌小瓶，立即送檢。
2、糞便採集時的注意事項
(1)標本應新鮮，採取標本後應立即送檢，不能超過1小時。標本久置可因pH及消化酶等因素而使糞便中細胞成分分解破壞。糞便標本不應用衛生紙包裹，請直接裝入不吸水的便盒內，以防水分丟失細胞被破壞。
(2)標本中不可混有尿液，更不可從尿壺或便盆中採取糞便標本，不得從尿布上取糞便標本，因為尿液可使糞中柔弱的原蟲致死，能使糞中胰蛋白酶活性檢查結果增高。
(3)應避免混入尿液、水、其他物質，以免破壞有形成分，使病原菌死亡。糞便標本中也不可混入植物、泥土、汙水等，因腐生性原蟲、真菌孢子、植物種子、花粉易混淆實驗結果。
(4)隱血試驗時應避免在檢驗前3天服用大量維生素C，禁食動物性食物，血類食品，並禁服鐵劑，鉍劑，避免混入經血、尿液、如口鼻出血有過吞嚥也會影響結果。應連續送檢3天。
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