外科治療門靜脈高壓症主要是針對門靜脈高壓症食道胃底靜脈曲張導致的上消化道出血，目前已經達成的共識是：對於發生過上消化道出血的患者，由於存在非常高的再出血率，如果肝功能良好，應首先選擇外科手術治療；沒有發生過出血的患者，可以應用普納洛爾等藥物降低門脈壓力，不推薦應用外科手術進行預防性治療。
由於脾切除術後存在的一系列問題，對於單純脾功能亢進的患者，不推薦進行脾切除術。
具體的外科手術方式包括以下幾種，應根據患者的具體情況進行選擇。
1、斷流術：傳統斷流手術的範圍包括賁門周圍血管離斷術、食道下段離斷再吻合術以及脾切除術。其優勢是創傷小，在大多數醫院都可以實施，術後早期止血效果確切。但是由於目前國內很多醫院在開展斷流手術時，沒有實施食道下段離斷再吻合術，導致了術後再出血率高的問題。另外由於脾切除術後脾靜脈及門靜脈血栓的發生率高，造成部分患者肝功能受損，也是這一手術需要解決的難題。
2、保脾斷流手術：保脾斷流手術是近年來由北京大學人民醫院朱繼業教授和冷希聖教授提出的治療門靜脈高壓症食道胃底靜脈曲張破裂出血的最新治療方法。該手術在實施賁門周圍血管離斷術的同時，保留脾臟的功能，降低了門靜脈血栓的發生率。
3、分流手術：是採用門靜脈系統主幹及其主要分支與腔靜脈及其主要分支吻合，使較高壓力的門靜脈血液分流入腔靜脈中去，由於能有效的降低門靜脈壓力，是防治大出血的較為理想的方法。但是分流術後部分患者會發生肝性腦病，另外有些患者的分流通路容易發生血栓形成。目前較為理想的分流手術方式是遠端脾腎分流術。
4、肝移植術：肝移植是最為理想的治療門靜脈高壓症的手術方式，從根本上解除了門靜脈高壓症的病因，療效最為確切。但是由於供肝短缺以及費用問題，大多數患者無法獲得肝移植的機會。
鑑於外科手術的風險，對於存在門靜脈高壓症的患者，應選擇有經驗的醫院，採取有針對性的治療方式，不能盲目進行手術治療。
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