男性尿道炎一般以針對病原菌感染的藥物治療為主。一般分為淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎，一般伴隨尿痛及尿道分泌物，顏色微黃或呈膿性。
淋菌性尿道炎是通過性接觸傳播的，淋病奈瑟菌感染引起的，治療來說，在臨床上主要是以青黴素類抗生素和頭孢菌素類為首選，一般靜脈治療效果更強一些，例如頭孢曲松輸液治療3天。非淋菌性尿道炎，致病菌很多，以支原體，衣原體等多見，根據致病菌不同選擇敏感抗生素治療很重要。腸道細菌引起的急性尿道炎，可以使用左氧氟沙星抗感染治療。支原體或衣原體引起的尿道炎首選紅黴素類抗生素。
綜上所述，男性發生尿道感染，首選要明確診斷，尿常規，尿培養的基本檢查是必須的，在尿培養結果未出現前可以經驗使用抗生素治療，當然，由於泌尿系統相通，尿道炎繼發上尿路感染也是常見的，完善泌尿系B超有時也是需要的。
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