在胎兒時期膽道閉鎖診斷是十分困難的，因為其沒有明顯的解剖結構上面的畸形，或者僅僅有一些很微小的變化，超聲很難做出診斷。
一般四維彩超是在孕24周之前做的，即使有一些微小的症狀，受胎兒及母體的各種因素影響也是很難表現出來的。胎兒膽囊也是膽道系統的一部分，有很少部分膽道閉鎖的胎兒會在四維彩超檢查的時候表現出膽囊不顯示，在這些胎兒當中就可能會有先天性膽道閉鎖的胎兒，這部分胎兒的膽囊從產前直到出生後一直都不顯示，當然也不排除是先天性膽囊缺如或囊性纖維化。膽道閉鎖預後均較差。如果在胎兒四維彩超檢查時沒有發現膽囊顯示，那麼需要密切隨診複查或者進一步做羊水穿刺對消化酶進行檢測。即使是這樣，也很難在胎兒時期診斷出膽道閉鎖。
在臨床工作中先天性膽道閉鎖很罕見，而且無法在產前篩查出來的，所以超聲醫學對胎兒先天性膽道閉鎖的研究闡釋較少。
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