骨與軟組織腫瘤的分類和診斷極為複雜，單純依靠臨床檢查和影像學是很難做出正確的診斷，活檢是絕大部分骨與軟組織腫瘤診斷的必要途徑。活檢又分為穿刺活檢和切開活檢。
穿刺活檢是利用粗套管針，取出約0.3*0.3*1cm的組織，送病理診斷。粗套管針穿刺最好是在有大量的骨與軟組織腫瘤病例的醫院進行，有經驗的醫生才能拿到腫瘤組織，並且穿刺針道的設計要和手術入路一致，方能在手術中切除，所以，國外主張主刀醫生設計穿刺針道。穿刺病理診斷非常困難，樣本量少，診斷依賴於有豐富的骨與軟組織腫瘤病理經驗的專家。困難病理的診斷經常需要骨與軟組織腫瘤專科、病理和放射科醫生的討論確診。在我院骨與軟組織腫瘤科中，穿刺活檢診斷的正確率在90％以上，臨床上積累了豐富的經驗。經常應用於良性腫瘤，如骨化性纖維瘤、動脈瘤樣骨囊腫、骨母細胞瘤、骨鉅細胞瘤、脂肪瘤、神經鞘瘤等的診斷，惡性腫瘤：如骨肉瘤、轉移瘤、惡性纖維組織細胞增多症、纖維肉瘤、滑膜肉瘤、平滑肌肉瘤等的診斷。手術時間在20分鐘以內，手術切口在0.3cm左右，可以在局麻下開展，還有費用低、創傷小、恢復快等優點。
切開活檢往往在穿刺活檢失敗後進行，切口約6-8cm, 創傷大，恢復較慢，但取材的病理組織較多，有助於病理醫生的全面診斷。切開活檢也有很多技術細節，例如切口設計一定要在二次手術切除，術中無瘤操作，術後適當引流，防止血腫發生。非常遺憾，一些基層醫院開展切開活檢後，給二次廣泛切除腫瘤的保肢手術帶來困難，使患者喪失保肢的機會。
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