血尿的原因複雜，要按照嚴密的診斷程式進行診斷。
1、首先應判明是真性血尿或是假性血尿：
排除假性血尿後才能診斷為真性血尿。兒童常見的假性血尿是由於服用人造色素的食品、食物或藥物如大黃、利福平、苯妥英鈉等。另外，血紅蛋白尿、肌紅蛋白尿或卟啉尿也可使尿色呈紅色。
2、判定腎小球性或非腎小球性血尿：
腎小球性血尿來源於腎小球，非腎小球性血尿來源於腎盞、腎盂、輸尿管、膀胱和尿道。常用尿紅細胞形態進行鑑別。
3、按照腎小球性和非腎小球性血尿的常見疾病的臨床特點進一步檢查。
腎小球性血尿：
常見急性腎炎、慢性腎炎、IgA腎病、腎病綜合徵、紫癜性腎炎、狼瘡性腎炎、薄基底膜腎病、遺傳性腎炎等，臨床可根據病史、症狀、體徵及實驗室檢查進行鑑別。
非腎小球性血尿：
全身重症感染（敗血症、流行性出血熱等）、尿路感染、尿路結石、腎結核、多囊腎、泌尿系腫瘤、左腎靜脈壓迫綜合徵等等。
可能引起原因：
1、尿路感染引起的血尿：
一般為鏡下血尿，只有膀胱三角區炎症約l／3病例出現肉眼血尿，尿路感染的臨床表現是感染中毒症狀 區域性症狀是膀胱刺激症狀尿常規檢查有大量膿細胞或大量白細胞 膿細胞管型和白細胞管型有一定特異性，尿培養可找到致病菌 抗生素治療有效，一般不易與腎炎相混淆。
2、腎結核晚期都是累及整個泌尿系統：
一般都存在鏡下或肉眼血尿，典型病例洗肉水樣尿，病程長，膀胱刺激症狀較一般細菌感染更明顯，腎外往往找到結核病灶，一般抗生素治療無效，B超、CT、IVP腎盂造影檢查幫助較大 典型的影像學表現為一側腎結核對側腎積水 尿中可找到抗酸桿菌可確診 值得注意的是久治不愈的膿尿應想到腎結核的可能，應進一步行細菌學檢查，加以證實。
3、結石：
泌尿系統容易患結石症，當結石活動時，劃破黏膜，出現鏡下或肉眼血尿，同時伴有絞痛是其特點 絞痛從腎區開始沿側腹向膀胱大腿內側放射 影像學檢查可發現結石部位、大小、形狀、梗阻部位。
4、腫瘤：
是常見引起肉眼或鏡下血尿原因，腎癌無痛性全程血尿是其特點，男性發病率高，膀胱癌易誤診為膀胱炎 對於病程經久不愈 老年人久治不愈的膀胱激症狀 應想到膀胱癌的可能 B超 CT 膀胱鏡檢查可及早確診 及時採取相應的治療手段
5、左腎靜脈壓迫綜合徵：
亦稱胡桃夾現象，是兒童非腎性血尿常見的原因之一，為左腎靜脈匯入下腔靜脈的行程中，因走行於腹主動脈和腸繫膜上動脈之間形成的夾角受到擠壓而引起的臨床症狀。臨床上往往藉助於超聲來診斷，其診斷標準為：仰臥位左腎靜脈狹窄前擴張部位近端內徑比狹窄部位內徑寬3倍以上，脊柱後伸位15-20分鐘後，其擴張部位內徑比狹窄部位內徑寬4倍以上，符合其中1項即可診斷。
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