慢性咳嗽的病因相對複雜，明確病因是治療成功的關鍵。咳嗽原因不明或不能除外感染時，慎用糖皮質激素。
（一）咳嗽變異性哮喘（CVA）
CVA是一種特殊型別的哮喘，咳嗽是其惟一或主要臨床表現，無明顯喘息、氣促等症狀或體徵，但有氣道高反應性。主要表現為刺檄性乾咳，通常咳嗽比較劇烈，夜間咳嗽為其重要特徵。感冒、冷空氣、灰塵、油煙等容易誘發或加重咳嗽。常規抗感冒、抗感染治療無效，支氣管擴張劑治療可以有效緩解咳嗽症狀，此點可作為診斷和鑑別診斷的依據。肺通氣功能和氣道高反應性檢查是診斷CVA的關鍵方法。CVA治療原則與哮喘治療相同。大多數患者吸人小劑量糖皮質激素加β激動劑即可，很少需要口服糖皮質激素治療。治療時間不少於6~8周。
（二）鼻後滴流綜合徵（PNDs）
PNDs是指由於鼻部疾病引起分泌物倒流鼻後和咽喉部，甚至反流入聲門或氣管，導致以咳嗽為主要表現的綜合徵。
除了咳嗽、咳痰外，PNDs患者通常還主訴咽喉部滴流感、口咽黏液附著、頻繁清喉、咽癢不適或鼻癢、鼻塞、流涕、打噴嚏等。有時患者會主訴聲音嘶啞，講話也會誘發咳嗽，但其他原因的咳嗽本身也有此類主訴。通常發病前有上唿吸道疾病（如感冒）史。引起PNDs的基礎疾病包括季節性變應性鼻炎、常年性變應性鼻炎、常年性非變應性鼻炎、血管舒縮性鼻炎、感染性鼻炎、真菌性鼻炎、普通感冒和副鼻竇炎等。伴有大量痰液者多為慢性鼻竇炎所致。血管舒縮性鼻炎的特徵是隨氣溫改變，鼻腔有時會產生大量稀薄水樣分泌物。治療：依據導致PNDs的基礎疾病而定。由（1）非變應性鼻炎。（2）血管舒縮性鼻炎。（3）全年性鼻炎。（4）普通感冒。引起的PNDs首選第一代抗組胺劑（代表藥物為馬來酸氯苯那敏）和減充血劑（代表藥物為鹽酸偽麻黃鹼）。抗菌藥物治療是治療急性細菌性鼻竇炎的主要藥物，效果欠佳或分泌物多時可採用鼻腔吸入糖皮質激素及減充血劑減輕炎症。
對慢性鼻竇炎的治療，建議採用下列初治方案：應用對革蘭陽性菌、革蘭陰性菌和厭氧菌有效的抗菌藥物3周；口服第一代抗組胺劑和減充血劑3周；鼻用減充血劑1周；鼻吸入糖皮質激素3個月。內科治療效果不佳時可行負壓引流、穿刺引流或外科手術。
（三）嗜酸粒細胞性支氣管炎（EB）
主要症狀為慢性刺激性咳嗽，常是惟一的臨床症狀，一般為乾咳，偶爾咳少許黏痰，可在白天或夜間咳嗽。部分患者對油煙、灰塵、異味或冷空氣比較敏感，常為咳嗽的誘發因素。患者無氣喘、唿吸困難等症狀，肺通氣功能及唿氣峰流速變異率（PEFR）正常，無氣道高反應性的證據。治療：EB對糖皮質激素治療反應良好，治療後咳嗽消失或明顯減輕。支氣管擴張劑治療無效。
通常採用吸入糖皮質激素治療，二丙酸倍氯米鬆（每次250~500μg）或等效劑量的其他糖皮質激素，每天2次，持續應用4周以上。推薦使用乾粉吸入劑。初始治療可聯合應用潑尼鬆口服，每天10~20mg，持續3~7d。
（四）胃-食管反流性咳嗽（GERC）
因胃酸和其他胃內容物反流進入食管，導致以咳嗽為突出的臨床表現。GERC是慢性咳嗽的常見原因。典型反流症狀表現為胸骨後燒灼感、反酸、噯氣、胸悶等。有微量誤吸的GER患者，早期更易出現咳嗽症狀及咽喉部症狀。臨床上也有不少GERC患者沒有反流症狀，咳嗽是其惟一的臨床表現。咳嗽大多發生在日間和直立位，乾咳或咳少量白色黏痰。
診斷：患者咳嗽伴有反流相關症狀或進食後咳嗽，對提示診斷有一定意義。24h食管pH值監測是目前診斷GERC最為有效的方法。治療：（1）調整生活方式：減肥，少食多餐，避免過飽和睡前進食，避免進食酸性、油膩食物及飲料，避免飲用咖啡及吸菸。高枕臥位，升高床頭。（2）制酸藥：常選用質子泵抑制劑（如奧美拉唑或其他類似藥物）或H2受體拮抗劑（雷尼替丁或其他類似藥物）。（3）促胃動力藥：如多潘立酮等。（4）如有胃十二指腸基礎疾病（慢性胃炎、胃潰瘍、十二指腸炎或潰瘍）伴有幽門螺桿菌感染患者均應進行相應的治療。（5）內科治療時間要求3個月以上，一般需2~4周方顯療效。少數內科治療失敗的嚴重反流患者，可考慮抗反流手術治療。
其他慢性咳嗽的病因及診治
（一）慢性支氣管炎
為咳嗽、咳痰連續2年以上，每年累積或持續至少3個月，並排除其他引起慢性咳嗽的病因。咳嗽、咳痰一般晨間明顯，咳白色泡沫痰或黏液痰，加重期亦有夜間咳嗽。一般需抗生素治療。
（二）支氣管擴張症由於慢性炎症引起氣道壁破壞，導致非可逆性支氣管擴張和管腔變形，主要病變部位為亞段支氣管。臨床表現為咳嗽、咳膿痰甚至咯血。典型病史者診斷並不困難，無典型病史的輕度支氣管擴張症則容易誤診。X線胸片改變（如捲髮樣）對診斷有提示作用，懷疑支氣管擴張症時，最佳診斷方法為胸部高解析度CT。需抗菌及化痰治療。
（三）變應性咳嗽（AC）
刺激性乾咳，多為陣發性，白天或夜間咳嗽，油煙、灰塵、冷空氣、講話等容易誘發咳嗽，常伴有咽喉發癢。通氣功能正常，誘導痰細胞學檢查嗜酸粒細胞比例不高。治療：對抗組胺藥物治療有一定效果，必要時加用吸入或短期（3~7d）口服糖皮質激素。
（四）感冒後咳嗽當感冒本身急性期症狀消失後，咳嗽仍然遷延不愈，臨床上稱之為感冒後咳嗽。除了唿吸道病毒外，其他唿吸道感染亦可能導致此類遷延不愈的咳嗽，有文獻統稱為感染後咳嗽。患者多表現為刺激性乾咳或咳少量白色黏液痰，可以持續3~8周，甚至更長時間。X線胸片檢查無異常。
感冒後咳嗽常為自限性，通常能自行緩解。抗菌藥物治療無效。對一些慢性遷延性咳嗽可以短期應用抗組胺H1受體拮抗劑及中樞性鎮咳藥等。對少數頑固性重症感冒後咳嗽患者，在一般治療無效的情況下可短期試用吸入或者口服糖皮質激素治療，如10~20mg潑尼鬆（或等量其他激素）3~7d。
（五）支氣管內膜結核：支氣管內膜結核在慢性咳嗽病因中所佔的比例尚不清楚，但在國內並不罕見，多數合併肺內結核，也有不少患者僅表現為單純性支氣管內膜結核，其主要症狀為慢性咳嗽，而且在有些患者是惟一的臨床表現，可伴有低熱、盜汗、消瘦等結核中毒症狀，查體有時可聞吸氣性幹羅音。X線胸片無明顯異常改變，臨床上容易誤診及漏診。
對懷疑支氣管內膜結核的患者應首先進行普通痰塗片找抗酸桿菌。部分患者結核分枝桿菌培養可陽性。X線胸片的直接徵象不多，可發現氣管、主支氣管的管壁增厚、管腔狹窄或阻塞等病變。CT特別是高解析度CT顯示支氣管病變徵象較X線胸片更為敏感，尤其能顯示葉以下支氣管的病變，可以間接提示診斷。纖支鏡檢查是確診支氣管內膜結核的主要手段，鏡下常規刷檢和組織活檢陽性率高。
（六）血管緊張素轉換酶抑制劑（ACEl）誘發的咳嗽：咳嗽是服用ACEI類降壓藥物的常見不良反應，發生率約在10％~30％，佔慢性咳嗽病因的1％~3％。停用ACEI後咳嗽緩解可以確診。通常停藥4周後咳嗽消失或明顯減輕。血管緊張素Ⅱ受體拮抗劑可以替代ACEIs。
（七）心理性咳嗽心理性咳嗽是由於患者嚴重心理問題或有意清喉引起，又有作者稱為習慣性咳嗽、心因性咳嗽。小兒相對常見，在兒童1個月以上咳嗽病因中佔3％~10％.典型表現為日間咳嗽，專注於某一事物及夜間休息時咳嗽消失，常伴隨焦慮症狀。
心理性咳嗽的診斷系排他性診斷，只有其他可能的診斷排除後才能考慮心理性咳嗽。兒童心理性咳嗽的主要治療方法是暗示療法，可以短期應用止咳藥物輔助治療。對年齡大的患者可輔以心理諮詢或精神干預治療，適當應用抗焦慮藥物。
（八）其他少見病因如支氣管肺癌、肺間質纖維化、支氣管微結石症、左心功能不全等。
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