1、中毒性腸擴張：這是本病的一個嚴重併發症，多發生在全結腸炎的病人，死亡率可高達44％，臨床表現為病情迅速惡化，中毒症狀明顯，伴有腹瀉、腹部壓痛和反跳痛，腸鳴音減弱或消失，白細胞數增多，易併發腸穿孔。
2、腸狹窄：多發生在病變廣泛、病程持續長達5-25年以上的病例，其部位多見於左半結腸，乙狀結腸或直腸，臨床上一般無症狀，嚴重時可引起腸阻塞，在本病出現腸狹窄時，要警惕腫瘤，鑑別良性惡性。
3、腸穿孔：多為中毒性腸擴張的併發症，也可出現嚴重型，多發生於左半結腸，皮質激素的應用被認為是腸穿孔的一個危險因素。
4、腸息肉、結腸癌：結腸炎超過五年，腸道潰瘍面在炎症的長期刺激下容易異常增生，引發腸息肉，一釐米以上腸息肉癌變率極高；另外，約5％腸炎病例可發生癌變，多見於病變累及全結腸，幼年起病和病史超過10年者。
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