1、腹部觸診
左下腹部或下腹部可有壓痛，病重出現腹部壓痛、反跳痛、腹肌緊張，應注意併發急腹症。
2、內窺鏡檢查
這是非特異性潰瘍性結腸炎目前最重要的檢查手段。鏡下見腸段黏膜充血、水腫、粒狀突起、多發性點狀或斑片狀淺小糜爛或潰瘍，表面有黏液或黃白苔。腸黏膜較脆弱，鏡角擦過易出血，由於水腫和淋巴組織增生，可見假性息肉。
3、X線檢查
腸黏膜皺襞紋理紊亂，腸管邊緣模糊，重者腸管邊緣可見毛刺狀或鋸齒狀變化。如見圓形充盈缺損，常為假性息肉，重者，腸袋消失，腸管呈狹長的鉛管狀。
4、實驗室檢查
(1)糞便檢查 肉眼可見有血、膿、黏液，急性期鏡下可見大量紅細胞、白細胞、膿細胞、巨噬細胞，大便培養無致病菌。
(2)血液檢查 重患者多有輕中度貧血，血紅蛋白減少，白細胞多正常，重症者可明顯增高，出現核左移或中毒顆粒等，血沉增快是活動的重要標誌之一。
血清蛋白電泳亦可作為本病活動性的重要標誌。
α1糖蛋白增高-處在活動期，
α2糖蛋白增高-病情緩解。
病情重 電解質紊亂，低K最常見，低Na次之，也可見低Mg。
(3)免疫學檢查 體液免疫：活動期測免疫球蛋白，可見IgG、IgM、IgA增高，以IgG明顯增高最為多見。
細胞免疫 部分患者T、淋巴細胞百分數低於正常。
5、病理檢查
見黏膜炎性細胞浸潤，異性上皮細胞增生，腺體排列異常，上皮纖維化，有隱窩形成等。
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