真性細菌尿是指中段尿細菌定量培養≥10^5/ml或恥骨上膀胱穿刺尿細菌定性培養兩次都有細菌生長。真性細菌尿的主要病因是尿路感染。
真性菌尿的鑑別診斷：
無症狀性菌尿：
又稱隱匿型菌尿，是一種隱匿型尿路感染，即指病人有真性細菌尿（清潔中段尿細菌定量培養連續2次大於105/ml，且2次菌種相同，並確切排除了結果的假陽性）而無任何尿路感染的症狀，但在有的病例經仔細詢問可發現輕微症狀。其細菌來自腎臟或來自膀胱。無症狀性細菌尿比有症狀者發病率要高，在16～ 65歲的女性中發病率均為4％，男性為0.5％，在女性患者中雖然有1/4菌尿可自行消失，但亦不斷髮生新的細菌尿，故4％的發病率是相當恆定的。
菌尿：
通常情況下，尿液是無菌的，但是尿道口周圍及尿道的下1/3是有菌的。因此，從人體排出的尿液可以沾染上一部分細菌。但是，清潔中段尿的含菌量不應超過105/毫升。如果連續兩次化驗含菌量大於或等於105/毫升，且為同一菌種，又沒有尿路感染（尿頻、尿急或下腹不適等）症狀，就可診斷為真性菌尿，又稱為無症狀性菌尿。
腎性糖尿：
是指在血糖濃度正常或低於正常腎糖閾的情況下，由於近端腎小管重吸收葡萄糖功能減低所引起的糖尿的疾病。臨床上分為原發性腎性糖尿和繼發性腎性糖尿。
白細胞尿：
指新鮮離心尿液每個高倍鏡視野白細胞超過5個，或者一小時新鮮尿液白細胞數超過40萬或者12小時尿液中超過100萬個。
高草酸尿：
原發性高草酸尿症為少見的遺傳性疾病，有兩種臨床型別，即Ⅰ型和Ⅱ型高草酸尿症，均屬常染色體隱性遺傳。兩型在臨床表現上無明顯區別，男女發病比例約為1.3∶1，約12％患者在1歲以前發病。65％在5歲以前發病。本病主要表現為腎結石、腎鈣鹽沉著及腎外組織鈣鹽沉著。患者有反覆發作的腎絞痛和血尿，常繼發腎盂腎炎和腎盂積水。腎外組織鈣鹽沉著多發生於心髒、男性生殖器官和骨骼。草酸鈣結晶則可沉著於血管壁。病情進展迅速，逐漸出現尿毒症，此時可合併繼發性甲狀旁腺功能亢進。嬰兒期發病者多在20歲以前死亡，成年發病者預後相對較好。
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