牛奶中最主要的過敏原是乳清蛋白和酪蛋白。不同種系哺乳動物的奶抗原間存在交叉反應，最有同源性的是牛、綿羊和山羊的奶蛋白。
牛奶蛋白過敏可出現下列症狀：口腔粘膜瘙癢、脣舌水腫、咽喉部緊憋感；噁心、嘔吐、腹部絞痛、腹瀉，有時帶血便；蕁麻疹，全身性斑丘疹，面板潮紅及血管性水腫；鼻癢、鼻塞、鼻涕、噴嚏。
牛奶蛋白過敏的治療：治療的關鍵原則是飲食中限制牛奶蛋白。人乳餵養嬰兒，以及2歲以上的發生牛奶蛋白過敏的兒童，不必採用替代配方。人乳餵養的嬰兒發生牛奶蛋白過敏時，母親避免食用牛奶製品，可繼續人乳餵養，但需要補鈣。非人乳餵養的嬰兒，可採用的替代配方包括深度水解牛奶配方、大豆配方、大豆和大米水解物配方和氨基酸配方。
面對如此多的配方，該如何選擇使用？可遵循以下原則：
1、過敏嚴重者，首選氨基酸配方；
2、過敏症狀較輕者，建議先用深度水解牛奶配方；（因為氨基酸配方價格較高且口感更差，如價格與口感都不成問題，還是應用氨基酸配方更理想）
3、深度水解牛奶配方的營養優於大豆配方；（<6月齡嬰兒不宜採用大豆配方）
4、深度水解牛奶配方優於深度水解大米配方；
5、如因特殊原因不能採用低敏配方時，可考慮用其他的奶源。但山羊、綿羊、水牛的乳汁不宜用於治療牛奶蛋白過敏，因可能導致嚴重過敏反應。駱駝奶可作為2歲後兒童的替代品，馬奶可用於有延遲反應的牛奶蛋白過敏兒童。
療程：至少3～6個月，建議每3～6個月重新評估以調整迴避性飲食治療時間。輕症牛奶過敏（主要指輕症溼疹）嬰兒：一般不推薦長期使用氨基酸配方奶粉、深度水解蛋白配方奶粉。可使用氨基酸配方奶粉、深度水解蛋白配方奶粉1～3個月後嘗試新增適度水解蛋白配方奶粉，如能適應則持續使用;如不能適應，應在1～2年後再嘗試新增適度水解蛋白配方奶粉。也可直接試用適度水解蛋白配方奶粉。
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