胚胎停育是指因受精卵缺陷或母體存在不利妊娠的因素，導致早期或中期胚胎死亡，全部或部分的組織留在官腔內未能自然排出的一種病理性妊娠。有報道統計胚胎停育佔早期妊娠的10％～18％，且近年來有逐漸增高的趨勢，妊娠結局為反覆流產。
導致胚胎停育的原因非常複雜，包括了遺傳因素所導致的孕卵或胚胎髮育異常、感染因素、免疫異常、 母體內分泌失調、子宮因素、全身性疾病、手術創傷等原因，除此之外還有約40％～50％的胚胎停育原因未明。
遺傳因素
包括父母雙方或某一方染色體異常及 胚胎染色體檢測異常、染色體數目及結構異常、基因突變、基因多型性等，在自然流產絨毛中染色體異常的檢出率高達55％～66％。
免疫因素
據報道，40％～60％的胚胎停育與免疫因素有關。受精卵在母體宮腔內的種植可認為是一種半同種移植現象，妊娠發生時，免疫細胞會在母胎介面通過複雜的免疫調節機制產生免疫耐受作用，維持胚胎髮育所需的微環境，通過免疫調節作用使胚胎不被排斥。子宮蛻膜中的主要免疫活性細胞有含量豐富的自然殺傷(NK)細胞、T細胞和巨噬細胞。成功的胎盤植入取決於NK細胞對滋養層抑制或活化反應的正確平衡。
感染性因素
常見的病原體有：衣原體(CT)、支原體(UU)、弓形 蟲(TOX)、鉅細胞病毒(HCMV)、加德納菌感染等。宮腔受到陰道加德納菌感染侵犯，會引起官腔炎症，破壞羊膜、絨毛膜組織結構，降低其組織功能，其內毒素又可誘導多種細胞因子釋放，這些細胞因子對子宮內膜存在一定的毒性作用，損害妊娠組織的生長，導致胚胎髮育停滯。
內分泌因素
黃體功能缺陷、多囊卵巢綜合徵、子宮內膜異位症、高泌乳素血癥、甲狀腺功能異常、未控制的糖尿病等。月經期子宮內膜雌孕激素受體、細胞凋亡bcl一2基因家族及其調控因子bax蛋白的表達出現紊亂，破壞了子宮內膜為著床準備的區域性微環境，從而造成不孕或流產；多囊卵巢綜合徵患者由於長期無排卵，雌、孕激素分泌不協調，使著床期子宮內膜與種植相關的基因表達減弱，從而影響胚胎著床過程中的多個環節。近期研究發現，妊娠早期促甲狀腺激素升高可導致自發性流產發生風險增加；另外，孕激素作為一種甾體激素，在妊娠建立和妊娠維持過程中發揮著核心作用。
細胞增殖和凋亡
正常妊娠過程中胎盤絨毛和蛻膜的細胞凋亡和增殖處於一種平衡狀態。自然流產妊娠組織中存在著過度凋亡，而且過度凋亡的發生與促凋亡基因的高表達有關。當滋養細胞侵襲力不足，胎盤血管增殖不良，且凋亡的“促進-抑制平衡”被打破時，可能會導致病理妊娠的發生。
解剖因素
子宮畸形（如子宮發育不良、雙子宮、單角子宮、 雙角子宮、子宮中隔等），子宮肌瘤（如黏膜下肌瘤及某些壁間肌瘤）、子宮腺肌瘤、官腔粘連等，均可影響胚胎著床發育而導致流產。
環境及個人因素
電磁輻射、大氣汙染、精神緊張均是胚胎停育的誘因。另外，女性個人不良生活習慣如酗酒、吸菸、毒品及咖啡等；月經史、孕產史、口服避孕藥史、孕期服藥史、婦產科疾病史、手術創傷及慢性疾病史，宮內感染、早孕期高燒史、孕期X線 照射史及早孕期精神受挫、焦慮、生殖知識匱乏等都可能是增加胚胎停育的危險因素。
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