許多疾病可以合併尿路結石，這些疾病主要有：
1、原發性甲狀旁腺功能亢進症
甲狀旁腺腺瘤、甲狀旁腺增生等疾病都可以使甲狀旁腺素的分泌增加，導致骨骼脫鈣;還可以增加腸道對鈣的吸收，進而使血鈣、尿鈣升高。這是含鈣結石形成的重要原因。
2、外傷性截癱
由於截癱或外傷等原因長期臥床可引起骨骼脫鈣，併發生高鈣尿。另一方面，因為神經源性膀胱功能障礙也容易形成結石，尤其是在合併泌尿系感染時。
3、尿路梗阻性疾病
尿路任何部位的梗阻都可以導致結石的形成。較為常見的有前列腺增生症、尿道狹窄、輸尿管狹窄、腹膜後腫瘤壓迫輸尿管、腎盂輸尿管交界處梗阻等。尿路手術後再次發生的狹窄也可成為結石發生或復發的原因。
4、痛風
約10%的戒風患著會因血、尿中尿酸水增高而合成並尿酸結石。
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