新生兒甲狀腺功能減退症治療的目標是
(1)血清FT4：在參考值的50％的上限範圍;
(2)血清TT4：l至2歲10-16μg/dl，大於2歲在參考值的50％的上限範圍;
(3)血清TSH：<5.0 mIU/L，最佳範圍是0.5-2.0 mIU/L。
治療藥物及劑量
左旋甲狀腺素的起始劑量是(10-15)微克×公斤體重/天，每日一次服用。
新生兒各種病因的左旋甲狀腺素鈉推薦劑量：
甲狀腺發育缺如 :15微克×公斤體重/天。
異位甲狀腺：12微克×公斤體重/天。
甲狀腺激素合成障礙：10微克×公斤體重/天。
定期監測血清TSH、TT4：治療前6個月每2至4週一次，6個月至l歲每1至2個月一次，6個月至3歲每3至4個月一次，3歲至生長期結束每6個月一次。
左旋甲狀腺素鈉不要與其他食物混合服用，大豆蛋白、濃縮鐵劑和鈣劑都會影響藥物的吸收。服藥前最好空腹30至60分鐘。
確診甲減，應儘快開始選用左旋甲狀腺素治療，在1至2周之內使患兒血清甲狀腺素恢復到正常水平。2至4周血清TSH恢復至正常水平。 開始治療的年齡與患兒的智力發育顯著相關，出生2個月之內開始治療者智商與普通兒童無顯著差別;3個月開始治療者智商可以達到89;3～6個月開始治療者智商可以達到71;6個月以後開始治療者智商可以達到54。一定要早發現、早診斷、早治療。
評估甲減是否是永久性
如果初始甲狀腺掃描提示甲狀腺異位或缺如，則診斷為永久性甲減。
如果初始TSH<50mu/l，且在新生兒期過後tsh沒有升高，可在3歲時試驗性停止治療。如果停止治療後tsh升高，則考慮為永久性甲減。
注：此資訊源于網路收集，如有健康問題請及時咨詢專業醫生。