干擾素治療的絕對禁忌證包括：妊娠、精神病史 (如嚴重抑鬱症)、未能控制的癲癇、未戒斷的酗酒/吸毒者、未經控制的自身免疫性疾病、失代償期肝硬化、有症狀的心臟病。河南中醫學院第一附屬醫院艾研中心杜磊
干擾素治療的相對禁忌證包括：甲狀腺疾病、視網膜病、銀屑病、既往抑鬱症史，未控制的糖尿病、高血壓，治療前中性粒細胞計數 <1.0 × 109/L和（或）血小板計數 <50 × 109/L，總膽紅素＞51μmol/L（特別是以間接膽紅素為主者。）
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