由於膽囊頸管引起梗阻後，膽囊內積水不流通，積水就像池中的死水一樣，很容易引起細菌滋生和繁殖而感染，這樣就形成了膽囊積膿。臨床中應注意與其它疾病的鑑別診斷。
1、十二指腸潰瘍穿孔：多數病人有潰瘍病史。其腹痛程度較劇烈，呈連續的刀割樣痛，有時可致患者於休克狀態。腹壁強直顯著，常呈板樣、壓痛、反跳痛明顯；腸鳴音消失；腹部X線檢查可發現膈下有遊離氣體。惟少數病例無典型潰瘍病史，穿孔較小或慢性穿孔者病狀不典型，可造成診斷上的困難。
2、急性胰腺炎：腹痛多位於上腹正中或偏左，體徵不如急性膽囊炎明顯，Murphy徵陰性；血清澱粉酶升高幅度顯著；B超顯示胰腺腫大，邊界不清等而無急性膽囊炎徵象；CT檢查對診斷急性胰腺炎較B超更為可靠，因為B超常因腹部脹氣而胰腺顯示不清。
3、高位急性闌尾炎：其轉移性腹痛、腹壁壓痛、腹肌強直均可侷限於右上腹，易誤診為急性膽囊炎。但B超無急性膽囊炎徵象及Rovsing(羅符苯)徵陽性(按左下腹可引起闌尾部位的疼痛)有助於鑑別。此外，膽囊炎的反覆發作史、疼痛的特點，對鑑別診斷也有參考價值。
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