(1)急性或亞急性起病，多有發熱。
(2)有腦實質損害的症狀及體徵，如意識障礙，精神、行為異常，運動障礙，驚厥發作等。
(3)腦脊液檢查2/3 以上患兒可呈非化膿性改變。
(4) 病毒病因學檢查：是國內診斷的弱項，目前，就我國而言，多數病例的病毒病因學診斷仍存在一定困難。
(5)腦電圖檢查：當大腦皮層廣泛重度損害時，腦電圖示廣泛高電壓δ波，結合診斷指標，此時有輔助診斷的意義。不能僅靠臨床表現及腦電圖診斷病毒性腦炎，因腦電圖陽性特異性低、不能做病因學診斷。基底節型、腦幹型、小腦型腦炎腦電圖可以正常。
(6) 除外其它診斷。
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