過去，同時有膽囊結石和膽總管結石一般需要開腹手術治療（行膽囊切除+膽總管切開取石術），切除膽囊，探查膽總管，取出結石，並留置“T”管；隨著醫學科技的進步，現在不少醫院都可以應用腹腔鏡行膽囊切除和膽總管切開取石，部分病人可以直接縫合膽總管的切口，避免留置“T”管，縮短了治療的時間；另外還可以應用腹腔鏡和十二指腸鏡聯合治療膽囊結石和膽總管結石，即用腹腔鏡行膽囊切除術，同時行ERCP取出膽總管結石。
雖然方法是多種的，但臨床醫生會根據醫院的條件，病人的具體情況，如年齡、結石的大小、多少及分佈，選擇一個最適合的方法來進行相關的治療。
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