Positron emission tomography (PET)已經被用來嘗試區別膠質瘤的級別高低。後顱窩膠質瘤在兒童MR影像可以有很高的診斷率，但是成人的腫瘤由於結構不一致，所以現在使用PET來鑑別良惡性。有兩例病人的腦幹活檢和PET的結果一致，終有一天，PET影像可以在中腦背側病變的診斷率上比活檢高。
Magnetic resonance spectroscopy (MRS) 是一個無創的影像學檢查，檢查組織特點和獲得補充資料。肌氨酸、磷酸肌酸、膽鹼、N-乙醯天門冬氨酸、乳酸和脂類被用來分析不同的病理過程。它被用來區別正常和不正常組織以及腦腫瘤的級別，也可區別炎症、感染和腫瘤。
Diffusion tensor imaging (DTI)是一個表示白質的影象，可以表示感覺和運動的關係，在手術計劃中扮演重要角色。
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