並不是所有的腎結石都需要治療的。
當結石較小時，是可以觀察等待的，同結石和平共處的。
當結石較大時，以前的治療主要是開放手術(腎切開取石術)或ESWL術(體外衝擊波碎石術)。前者創傷大，後者往往需要多次ESWL，原則上對腎臟影響不大。但現在認為二次ESWL間隔時間需要10-14天為宜，且ESWL治療次數推薦不超過3-5次。結石震碎後，還需要自行排出來，往往會引起腎絞痛。
現在我科有二項微創治療腎結石的方法可供選擇。一種是MPCNL術(微創經皮腎穿刺碎石取石術)，僅在腰部打一個直徑5mm的小孔，從該孔直接進入腎盂，通過輸尿管鏡，採用鐳射或氣壓彈道等碎石工具來解決腎結石，並取盡。另一種操作是無傷口的手術，即通過輸尿管軟鏡技術，通過泌尿系統自然通道進入腎盂，再在腎盂內用鐳射將結石粉碎衝出。一般大的結石採用前者方案，小的結石採用後者方案，具體分界為直徑2cm。
附記： 經皮腎鏡術是通過建立從面板到腎集合系統的手術通道，經過面板不到1公分的小切口，放置內窺鏡進入腎盞和腎盂內，對腎內疾病進行診斷和治療的一種手術方法。經皮腎鏡技術是腔內泌尿外科技術的一個重要部分，尤其在治療上尿路結石方面，與輸尿管鏡術及體外衝擊波碎石術共同成為現代主要的治療方法，已經徹底改變了傳統開放手術的外科治療方式。近年來隨著臨床實踐和經驗的積累，技術及器械的改進，其操作方法有了很大的發展，治療範圍逐步擴大，適用於：
1、體積較大的結石，大於2cm以上;
2、鹿角狀腎結石;
3、腎下盞結石;
4、同時有結石遠端尿路梗阻;
5、其它治療方法失敗，如ESWL失敗後;
6、肥胖患者，面板至結石距離過大，ESWL定位有困難;
7、嵌頓性輸尿管結石。
經皮腎鏡碎石取石術創傷很小、不損傷肌肉、不影響運動功能、最大限度保留腎功能、出血少、術後恢復快。
目前國內外大部分醫生均採用俯臥位進行手術，這種體位患者很不舒適、影響呼吸，往往需要全身麻醉。有些醫院採用斜臥位進行經皮腎鏡碎石取石術，患者體位舒適，只需要硬膜外麻醉，既減少了創傷，還節省了費用。
注：此資訊源于網路收集，如有健康問題請及時咨詢專業醫生。