人體是一個有機的整體，各個部位總是與一定的經絡、臟腑相聯絡，故臨床上當疼痛固定在某一部位時，可在辨證論治同時，根據疼痛部位與所屬臟腑、經絡的關係，選擇適合於病情並能作用於特定部位的止痛藥，使藥力直達病所，增強療效。
頭痛：白蒺藜、藁本、全蠍、蜂房、葛根、天麻、鉤藤、蠶沙，川芎茶調散。
胸背痛：急性子、蚤休、三七、瓜蔞、徐長卿、威靈仙、丹蔘、桃仁、薤白，失笑散等。
乳房痛：青皮、絲瓜絡、王不留行、橘核、甲珠、荔枝核、皁刺，柴胡疏肝散等。
胃脘痛：九香蟲、香附、枳實、吳茱萸、乳香、蘇木、五靈脂、當歸，丹蔘飲等。
脅痛：八月札、青皮、桃仁、當歸、赤芍、澤蘭、丹皮、鬱金、薑黃、鱉甲，金鈴子散等。
腹痛：小茴香、紅藤、木香、枳殼、萊菔子、降香、烏藥、高良薑、肉桂、三稜、莪術，芍藥甘草湯等。
尿痛：瞿麥、王不留行、天葵子、琥珀、冬葵子、龍葵、白花蛇舌草，導赤散等。
腰腿痛：獨活、續斷、桑寄生、牛膝、地鱉蟲、蜈蚣、木瓜，青娥丸等。
骨轉移：透骨草、骨碎補、補骨脂、菟絲子、地鱉蟲、全蠍，自然銅散等。
晚期癌腫所引起的全身性關節、肌肉疼痛，常用藥物如劉寄奴、腫節風、防己、秦艽、海桐皮、桂枝、馬錢子、川烏，活絡效靈丹加減。
調節酸鹼度止痛
據文獻報道，疼痛可分為酸性疼痛和鹼性疼痛二種。鹼性疼痛時區域性有鈉、鈣等離子的積聚，癌腫常表現有壞死、潰瘍，同時尿液pH值升高。酸性疼痛時，疼痛區域性有乳酸之類的積聚，癌細胞常表現增生活躍，尿液pH值下降。有人提出病理性疼痛是神經末梢區域性的酸鹼度發生了改變所致，這種酸鹼度變化可從檢測尿情況反映出來，並可用相應的鹼性或酸性藥物加以糾正，從而使疼痛減輕或消失。對酸性疼痛常用的中藥有：川貝、薤白、辛夷、半夏、冬葵子、淡竹葉、白薇、薑黃、延胡。對鹼性疼痛常用的中藥有：五味子、訶子、山楂、白芍、山萸肉、川楝子、陳皮、青皮、金銀花、連翹、伸筋草等，臨床中可酌情考慮。
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