骨髓水腫是很多疾病的表象之一，通過骨髓水腫也可以初步診斷很多疾病，例如以下疾病：
一、骨感染性疾病
細菌性感染，例如骨關節結核、化膿性感染、或其他型別的病菌或病原體感染，這是由於感染時由於炎性細胞的侵潤而使得骨組織中的水成分增多，即骨髓水腫。
二、骨關節外傷
由於骨折、骨損傷（雖沒有骨幹的骨折，但是存在骨小樑的骨折）、疲勞骨折等而使得病骨中水成分增多。
三、腫瘤
在某些骨腫瘤，尤其是惡性骨腫瘤中，由於腫瘤細胞的侵潤或或其他伴隨的病理因素而導致病變區或鄰近骨組織的水成分增多。
四、骨的缺血性疾病
由於缺血造成骨組織的壞死，在進展期：病變區骨小樑中斷、破碎，這樣使得壞死區或相鄰骨組織的水成分增多。
五、骨關節免疫性疾病
最常見的是類風溼性關節炎、強直性脊柱炎等，由於滑膜或肌腱韌帶等軟組織增生性病變而引起的骨質病變，骨的病變區出現單核細胞、淋巴細胞等炎性細胞侵潤而伴水成分增多。
六、退行性骨關節病
由於椎間盤退變或關節軟骨的退變與破壞，形成椎體終板炎或軟骨下囊變或水腫。
七、血液系統的疾病
例如白血病，由於白血病細胞的骨髓侵潤而同時伴隨骨髓水腫。
八、其他
如一過性的原因不明的骨髓水腫（比如常見的股骨頭、頸，屬於自限性疾病，原因不明）；中毒性骨病，如鎘中毒等造成骨溶解而伴骨髓水腫；痛風性關節病（嘌呤代謝異常）等。
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