1、喉部併發症：據統計，耳鼻喉科病人有喉部症狀和發聲障礙者，約半數胃食管反流為其發病原因，或為發病的有關因素。與反流有關的喉部症狀有慢性發聲困難、間歇性發聲困難、聲帶疲勞、聲音破碎、長期清喉習慣、喉黏液過多、鼻涕後流、慢性咳嗽、吞嚥困難、癔球症等。反流作為發病原因或協同因素有反流性喉炎、聲門下狹窄、喉癌、聲帶接觸性潰瘍或肉芽腫、聲帶後狹窄、單側或雙側杓狀軟骨固定、陣發性喉痙攣、咽部癔球徵、聲帶小結、息肉樣變性、喉軟骨軟化、喉厚皮病和喉白斑等。
2、慢性咳嗽胃食管反流是慢性咳嗽的一重要原因，居引起該咳嗽原因的第3位，從兒童到成年人均如此。慢性咳嗽的發生既與呼吸道誤吸有關，也與神經反射有關。神經反射的傳入和傳出通路均是經迷走神經。
GERD的咳嗽半數以上為乾咳，用24小時pH監測發現咳嗽經常見於清醒狀態和直立位時，而不是發生於夜間。病人常沒有胃食管反流症狀，如燒心、反酸等，故50%～75%的病人否認有反流病史。用長時間pH監測證實，咳嗽往往是惟一症狀，但也可有典型反流症狀，或非典型症狀，如胸痛、噁心、哮喘和聲音嘶啞。
3、哮喘：哮喘病人中，GERD的發病率有不同的調查報告。Perrin-Foyolle等(1989)從連續150例哮喘病人中發現65%的病人有反流症狀。Connell(1990)報告連續189例哮喘病人中，72%有燒心症狀，半數病人夜間仰臥位時出現燒心症狀。18%夜間有咽喉部燒灼感。Field等(1996)報告109例哮喘病人中，77%有燒心症狀，55%有反胃，24%有吞嚥困難，37%的病人需用至少1種抗反流藥物。另有4個國家6家醫院報告的527例成年哮喘病人，經食管pH監測證實有胃食管反流者362例(69%)。內鏡連續觀察186例哮喘病人，39%有食管黏膜糜爛或潰瘍形成，13%有Barrett食管。食管裂孔疝作為胃食管反流的間接表現，50%的哮喘病人有食管裂孔疝。8項研究共783例哮喘兒童，通過短時間pH試驗、長時間pH監測或放射線觀察食管裂孔疝等方法，發現有胃食管反流者自47%～64%不等，平均56%，與報告的成年人發病率近似(Sontag，1999)。從以上材料可以看出，胃食管反流與哮喘經常同時存在，在兒童或成年哮喘病人中，胃食管反流的發病均甚高，這一點值得臨床醫師注意和重視。
4、口腔併發症：酸性胃內容物停留於口腔可引起口腔疾病，其中牙侵蝕最為突出。酸性物長期作用於牙齒，便形成牙侵蝕，這是一長期酸暴露的化學變化過程。起初為牙釉質表面受蝕，光澤消失;經年的腐蝕作用使牙釉質逐漸破壞，質地較軟的和抗酸能力很差的牙本質即暴露於酸，在酸的作用下，牙本質破壞更快。對溫度變化、甜食和酸性食物過敏。Jarvinen(1988)研究了109例有上消化道症狀的人，反流性食管炎病人中55%有口腔症狀，如口腔燒灼感、舌敏感及痛性潰瘍。另有117例有反流的病人，經對其口、齒和唾液腺進行研究，大多數病人經常感受到口乾、齒敏感、非特異性口腔內癢或燒灼感，或咽部症狀(Meurman，1994年)。反流的病人除了有牙齦炎和牙周炎，還可因長期反酸而使唾液腺增大，特別是腮腺。腮腺增大的原因可能是反覆酸性反流物刺激口腔，使腮腺過度分泌所致。
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