CT掃描發現肝內低密度灶，說明這個病灶是囊液性的，密度低於肝實質。這類病灶一般是肝囊腫、肝膿腫、肝血管瘤或少見的肝包蟲病等。
肝囊腫是最常見的肝臟良性疾病。囊腔通常不與肝內膽管系交通，囊腫是由上皮是細胞排列組成的閉合腔隙，內含液體，可為單發性或多發性，大小不一，數目從一個到幾十個貝登。肝囊腫絕大數生長緩慢，一般無明顯症狀，僅在體檢時被偶然發現。巨大的肝囊腫可出現明顯的壓迫症狀。若合併感染，可出現畏寒、發熱、腹痛等類似肝膿腫的症狀。
肝膿腫：肝膿腫是一種肝臟嚴重感染性疾病，是細菌、真菌或溶組織阿米巴原蟲等多種微生物引起的肝臟化膿性病變，患者多伴有發熱、右上腹痛等症狀。若不積極治療，死亡率可高達10%～30%。肝臟內管道系統豐富，包括膽道系統、門脈系統、肝動脈系統及淋巴系統，大大增加了微生物寄生、感染的概率。肝膿腫分為三種類型，其中細菌性肝膿腫常為多種細菌所致的混合感染，約為80%，阿米巴性肝膿腫約為10%，而真菌性肝膿腫低於10%。細菌性肝膿腫需要積極治療，加強營養支援，給與強力抗感染治療，同時給予穿引流或者外科手術引流。
肝血管瘤：肝血管瘤是一種較為常見的肝臟良性腫瘤，臨床上以海綿狀血管瘤最多見，病人多無明顯不適症狀，常在B超檢查或在腹部手術中發現，一般不需要治療。按病理可分為4型：（1）海綿狀血管瘤最為常見；（2）硬化性血管瘤；（3）血管內皮細胞瘤；（4）毛細血管瘤。按照腫瘤大小分類：（1）小血管瘤<5cm；（2）血管瘤5～10cm；（3）巨大血管瘤10cm～15cm；（4）特大血管瘤>15cm。
?肝血管瘤雖然是瘤，但不是普通意義的腫瘤，是指是肝內血管發育異常導致，當然也有其它的因素如感染、激素變化等導致的。小的血管瘤，沒有症狀，不會影響肝臟功能和患者生命，因此不需要治療。但是當血管瘤變大，壓迫肝臟導致肝功能異常或者血管瘤位於肝臟表面，有破裂風險的，需要積極治療。治療方式包塊介入區域性治療或者外科手術治療。
肝包蟲病：肝包蟲病是牧區較常見的寄生蟲，也稱肝棘球蚴病。在中國主要流行於畜牧業發達的新疆、青海、寧夏、甘肅、內蒙和西藏等省區。病因是幼蟲寄生在動物體內（如夠，牛、等），人吞食被蟲卵汙染的食物感染。蟲卵經腸內消化液作用，蚴脫殼而出，穿過腸黏膜，進入門靜脈系統，大部分被阻留於肝臟內。蚴在體內經3周，便發育為包蟲囊。會在肝臟內形成大大小小的有包膜的囊性佔位。
除此之外，對於其它部位有原發癌症的患者，如果CT提示肝臟有低密度灶，一般不用擔心，但是，要引起足夠的重視，最好複查肝臟增強核磁共振，進一步明確是否有轉移的可能。肝臟增強核磁共振在鑑別診斷方面優於CT。
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