做胎心監護的最佳時間要根據孕婦和胎兒的情況具體來定，多數在兩餐之間進行較好，特殊狀況則需根據具體病情來決定。
一般而言，在產檢時常規做胎心監護時，應該選擇兩餐之間，身體情況良好，避開較為疲勞或飢餓的狀態，並儘量在胎兒胎動相對較為活躍時間段裡較好。此時胎兒處於活躍的狀態，觀察胎心監護中胎動、胎心的變異和反應比較明顯，如果胎兒處於一天之中較為安靜的時段，胎心監護的變異反應有可能會不理想，造成胎心監護異常的假陽性結果。
對於有急症或異常情況需要，比如感到胎動減少或發生妊娠併發症，如子癇前期，則需要根據病情隨時做胎心監護，不能自由選擇時間。
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