食管癌的一級預防即病因學預防：是指消除或減少可能致癌因素，防止癌症的發生。主要包括防癌宣傳、控制吸菸、環境治理、倡導健康的生活方式及飲食習慣等等。在食管癌高發區先後施行的改水、防黴去胺、晒糧、晒水、施鉬肥、補充微量元素、推廣核黃素鹽等措施，均屬於一級預防措施。總的來說，一級預防顯效緩慢。
食管癌二級預防（即三早防治）：是指早期發現、早期診斷、 早期治療食管癌。通過在高危人群中行電子胃鏡篩查，實現早期發現和診斷食管癌和癌前病變。對篩查出的早期癌和癌前病變進行內鏡微創治療，達到早期治療的目的。食管早期癌治療後5年生存率可達95％以上，而中晚期癌治療後5年生存率只有25％左右，差距是相當大的。在癌症一級預防顯效緩慢的情況下，“三早防治”是世界範圍內公認的提高癌症生存率、降低死亡率的最有效方法。
食管癌三級預防：主要是通過對惡性腫瘤患者進行手術、放療、化療、生物療法等相應的對症治療，進而提高治癒率、生存率及病人的生存質量，並能減輕患者的痛苦，延長生命。
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