因為術中不使用血管收縮藥物和仔細的止血，術後出血的機會很小。術後3天內有少量出血，尤其在早晨起床時，或者長時間臥床後坐起後，這通常由於在蝶竇鞍區術中積聚的血液流出。如果出血多需要到醫院行鼻內窺鏡檢查。
術後如果有少量液體漏出也是正常的，一般可以在1天或幾天內自行消失。如果遇到不能停止的或大量的液體流出，需要考慮腦脊液漏。尤其不能停止的大量流清水，在坐位頭前傾時更為明顯，必須馬上考慮腦脊液漏修補術，避免腦炎的發生。如果在鞍結節發生腦脊液漏手術最不好做，因為填塞的脂肪可以壓迫兩側的視神經和後部的視交叉。修復嗅溝和斜坡的腦脊液漏相對容易。
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