透析中頭疼的發生率為5％，大多數原因不明確，常見原因有：
1、失衡綜合徵
發生率為3.4％-20％，是在透析中後期或者結束後不久發生的與透析有關的以神經系統症狀為主的綜合徵。充分合理誘導透析，是減少失衡綜合徵的重要措施。
2、高血壓
在透析中因血壓升高引起的頭痛。其發生率不高，但原因不清楚，而且比較頑固，難以處理。舌下交替含服開博通、心痛定、對輕、中度高血壓有效。對於難治性高血壓可用硝普鈉或酚妥拉明靜點，也可以配合使用鎮靜藥，如安定10毫克肌注。嚴重高血壓，經處理血壓不能下降，應中止透析，中止後血壓逐漸恢復正常。
3、硬水綜合徵
是由於用硬水進行透析時出現的急性高鈣血癥或高鎂血癥。臨床表現為嚴重頭痛、噁心、嘔吐、全身溫熱感、面板瘙癢及發紅、呼吸困難、心前區壓迫感、脈緩、輕度高血壓，甚至驚厥。透析前常規做硬水試驗，如出現症狀，不應透析。如透析後出現，沒有必要處理，因高鈣血癥在24-48小時內即可消退。
4、顱內出血
透析患者常合併高血壓和腦動脈硬化，顱內出血的病例也相應增多，突然血壓升高，過量使用抗凝劑或輕微外傷，都可能是出血的原因。多囊腎患者的腦血管意外，可能是由於腦動脈瘤破裂所致。處理方法，停止透析，給予魚精蛋白，進行暫時性腹膜透析，控制嚴重的高血壓。此外，硬膜下血腫、腦栓塞患者均可出現頭痛，應注意鑑別。
5、溶血
透析中因透析液溫度過高（＞40℃），機器的透析液監控裝置失靈及誤輸異型血等，均可引起急性溶血。臨床表現為沿穿刺靜脈疼痛不適、血壓下降、頭痛、腰痛、心前區痛、腦性抽搐、醬紫色尿等，應立即停止透析。溶血後透析器及管道內血液不要輸回體內，應輸新鮮血。注意糾正高血鉀。
6、醋酸鹽不耐受
對於不耐受醋酸鹽的患者，可以改用碳酸氫鈉透析液透析。
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