生酮飲食是從觀察飢餓能減少癲癇發作而開始的。很早以前，Hippocrates用飢餓療法來治療癲癇，Bible提到飢餓療法作為癲癇治療的一種方法。
早在20世紀20年代，美國醫生Hugh Conklin採用禁食而不禁水的辦法治療癲癇患兒，取得了很高的治療成功率，較多患者很長時間無癲癇發作。
1921年，美國Mayo Clinic的Wilder 醫生首先提出一種生酮飲食（高脂肪、低碳水化合物飲食）可模擬飢餓的代謝效果。
1924年美國Peterman醫生報道，應用該生酮飲食最初治療的17例病人中有10例癲癇發作完全控制，其中9例僅用生酮飲食。
1939年新的抗癲癇藥物苯妥因（大侖丁）問世，癲癇新的藥物治療時代開始了，與藥物比較，生酮飲食相對複雜、昂貴。當苯巴比妥以及苯妥英鈉治療癲癇有效時，人們對飲食治療的興趣就減退了。
20世紀90年代早期：生酮治療新時代的開始得益於一位好萊塢製片人DD亞伯拉罕，他的兒子查理患頑固性癲癇，花費10萬美元經多種藥物和其他治療無效，醫生告知患者預後為持續癲癇發作、進行性發育衰退。然後他得知生酮飲食療法，到約翰霍普斯金醫院開始了飲食治療，不服藥物，取得了完全無癲癇發作的效果，並堅持生酮飲食多年，能上學，過著正常幸福的生活。為了讓更多的父母知道生酮飲食，亞伯拉罕創立了查理基金，出版了一部生酮飲食的專著，為病人和醫生拍了一部關於生酮飲食的電影，拍了部電視版的電影“先採用無害的方法”，還資助了一個由7箇中心參與的生酮飲食研究。
1996年－至今：約翰霍普斯金醫院的作者報道了150例癲癇患兒，採用生酮飲食治療3，6，12月，以及3到6年隨訪情況。結果很有戲劇性。自1920年代以來，對不同的年齡組、不同的癲癇頻率、不同的國家報道的生酮飲食的療效結果基本一致。目前國際上普遍認為新型抗癲癇僅對30－40％的難治性癲癇兒童對有效（發作減少50％以上）；而生酮飲食對50-80％的難治性癲癇兒童對有效，30％的兒童可減少90％的發作，10-20％的患者可完全控制發作。通常接受飲食治療的年齡是1-10歲，但不排除其他年齡患者試用。目前，生酮療法在世界範圍內已得到較廣泛的開展，已有45個國家約80箇中心可提供生酮飲食治療。
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