治療
1、隨訪：如果甲狀腺功能正常，隨訪則是HT處理的主要措施。一般主張每半年到1年隨訪1次，主要檢查甲狀腺功能，必要時可行甲狀腺超聲檢查。
2、病因治療：目前尚無針對病因的治療方法。提倡低碘飲食。近年來出現了各種從免疫調節的角度來治療本病的新方法,能夠使患者的甲狀腺自身抗體水平下降,腫大的甲狀腺縮小。硒是人體內一種必需的微量元素，是一種抗氧化劑。具有防衰老、抗腫瘤、保護心血管、拮抗重金屬毒性等重要生理功能。硒可提高人體的免疫功能。硒干預治療可減輕或抑制自身免疫性甲狀腺炎的免疫損傷。
3、甲減和亞臨床甲減的治療：病人已有甲狀腺功能減低或明顯的亞臨床甲減時，必須用甲狀腺激素替代治療。治療的目標是將血清TSH和甲狀腺激素水平恢復到正常範圍。
左旋甲狀腺素鈉(L-T4)治療劑量取決於患者的病情、年齡、體重和個體差異。成人治療平均劑量為125μg/天，按體重為1.6～1.8μg /(kg・天)。老年患者需要較低劑量，大約1.0μg/(kg・天)。從小劑量開始，特別是對具有心血管疾病、病程較長、病情嚴重的老年患者。一般從每 天25～50μg開始，每1～2周增加25μg，直至達到完全替代目標。有心臟病者宜每天12.5～25μg開始，每2周增加12.5~25μg，以免誘發和加重心臟病病情。理想的L一T4服藥方法是早晨空腹服用1次。與其他藥物的服用間隔應當在4h以上，因為有些藥物和食物會影響它的吸收和代謝。治療初期，每間隔4～6周測定相關激素指標。然後根據檢查結果調整劑量， 直至達到治療目標。治療達標後，需要每6～12個月複查1次有關激素指標。
4、甲狀腺腫的治療：對於沒有甲減者，左旋甲狀腺素鈉(L-T4)可能具有減小甲狀腺腫的作用，尤其對近期內發生甲狀腺腫的患者效果更好。對甲狀腺 腫病程長的患者，甲狀腺激素的治療通常效果不顯著。糖皮質激素可以使腫大的甲狀腺縮小，並可使血中抗甲狀腺抗體的滴度降低;在甲狀腺生長迅速和疼痛不典型 的病人用皮質激素進行治療，可減輕區域性的症狀。但由於用藥以後的副作用及停藥以後病情可再發等原因，一般不推薦採用。甲狀腺腫大顯著、疼痛、有氣管壓迫， 經內科治療無效者，可以考慮手術切除。術後往往發生甲減，需要甲狀腺激素長期替代治療。
5、橋本甲狀腺炎伴亞甲減的治療最有爭議。對於TSH>10 mIU/L者一般主張給予左旋甲狀腺素治療。鑑於過度治療又會帶來一系列不良反應，如心血管疾病、骨質疏鬆症等， 因此多數學者提出，對TSH在4.5-10mIU/L的患者隨訪即可，特別是高齡老年患者。當然對於有明顯症狀的患者、TPOAb陽性者、欲懷孕者、孕婦以及少年兒童，則需要常規使用左旋甲狀腺素治療亞甲減。
6、TPOAb陽性孕婦的處理：對於妊娠前已知TPOAb陽性的婦女，必須檢查甲狀腺功能，確認甲狀腺功能正常後才可以 懷孕;對於妊娠前TPOAb陽性伴臨床甲減或者亞臨床甲減的婦女，必須糾正甲狀腺功能至正常才能懷孕;對於TPOAb陽性，甲狀腺功能正常的孕婦，妊娠期間需定期複查甲狀腺功能，一旦發生甲減或低T4血癥，應當立即給予L-T4治療，否則會導致對胎兒甲狀腺激素供應不足，影響其神經發育。
7、橋本病合併有結節需要注意確定結節的性質：如結節還小，建議定期超聲複查，首次是3個月複查。如果病人有顧慮，可以進行鍼吸活檢與細胞學檢查，如果診斷還不明確，可以進行手 術切除。橋本甲狀腺炎合併甲狀腺癌，近年來其發病率呈上升趨勢。橋本甲狀腺炎可能是發生甲狀腺癌的高危因素之一。
多數自身免疫性甲狀腺炎的長期預後是好的，屬良性過程。本病自然發展為甲狀腺功能減退的過程很緩慢。以前認為自身免疫性甲狀腺炎引起的甲低是永久性的。最近資料顯示，一些由自身免疫性甲狀腺炎引起的甲減病人，可以是暫時的甲減。這些病人在用甲狀腺激素替代時，大約有20％甲狀腺功能有自發的恢復。
另外,也觀察到不少腫大的甲狀腺可以縮小或消失，原來查到的甲狀腺結節在隨診中消失或縮小，硬韌的甲狀腺可能變軟。
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