功能神經外科的定義：採用手術的方法修正神經系統功能異常的醫學分支是為功能神經外科學，早期亦稱生理神經外科學，或應用神經生理學。手術針對特定的神經根、神經通路或神經元群，旨在有意識地改變其病理過程，重建神經組織的正常功能。
功能神經外科的治療範疇：
1、運動障礙病
曾被稱為錐體外系疾病，是基底節區病變導致的以運動功能紊亂為主要臨床特徵的疾病群。帕金森病是其中的典型代表，此外還包括原發性震顫、肌張力障礙、舞蹈症和抽動穢語綜合徵等。從影響運動功能的角度，腦癱也可歸為此類；
2、癲癇病
發作是癲癇病的主要臨床特徵，發作時的表現廣泛影響精神、運動、感覺和植物神經，發作間期可完全正常。依致癇灶解剖位置的不同可分為顳葉癲癇、額葉癲癇、頂枕葉癲癇和一些癲癇綜合徵等；
3、疼痛
常常是疾病的一種症狀，有些亦可單獨稱病。外科手術治療的是那些慢性的頑固性疼痛。典型的如帶狀皰疹神經痛、幻肢痛、截肢痛、丘腦痛、盆腔痛、腹腔痛、胸腔痛、腰背痛以及三叉神經痛、舌咽神經痛等。面肌痙攣是個例外，除少數伴隨三叉神經痛的面肌痙攣患者外，不應該包括在疼痛的範疇之內，但由於與三叉神經的治療一樣，微血管減壓手術有效，故常常放在一起討論；
4、精神紊亂
手術方法治療精神疾患的歷史可以追溯上百年，很多的努力放在了精神分裂症的治療上。氯丙嗪的出現使人們放棄了這種高致殘率的手術，近些年來，儘管手術技術的進步使嚴重併發症的威脅越來越小，但資料顯示精神分裂症的手術療效極其有限，比較肯定的手術適應症是焦慮症、強迫症和抑鬱症。
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