在慢性乙型肝炎的臨床治療中，抗病毒治療是治療的關鍵，許多病人對核苷類抗病毒藥物（如拉米夫定、阿德福韋、替比夫定、恩替卡韋等）的治療療程有許多疑問，根據目前世界各地新的治療指南做如下解釋，希望對廣大患者有所幫助。
慢性乙型肝炎的治療目標
09年歐洲肝臟研究學會（EASL)發表的新的《慢性乙肝臨床實踐指南》將治療目標定為：改善生活質量，延長生存期，阻止和延緩肝硬化、失代償期肝病、終末期肝病、肝癌和死亡的發生。抗病毒治療是實現這一目標的主要手段，抗病毒治療需要長期治療，但長期治療不等於終生治療，許多患者希望接受短期治療，這就要求有明確的治療終點和療程。
抗病毒治療的終點和療程
新指南中，理想的治療終點明確為：對HBeAg陰性的患者，乙肝病毒表面抗原（HBsAg)持續消失，伴有或不伴有HBs血清學轉換（HBsAb的出現）。對HBeAg陽性的患者，持久的HBeAg血清學轉換（HBeAg轉化為HBeAb)是滿意的治療終點；對於沒有獲得HBeAg血清學轉換的患者，HBVDNA保持在檢測不到水平是其次的治療終點。
07年美國肝病研究學會(AASLD)的治療指南指出：HBeAg（－）患者的治療終點也是HBsAg消失；HBeAg（＋）患者的治療終點是HBeAg血清學轉換（HBeAg轉化為HBeAb)後至少6個月。
08年亞太肝臟研究學會（APASL）指南中指出：HBeAg（－）患者的治療終點為每6個月檢測一次，連續3次HBVDNA達到不可檢測水平；HBeAg（＋）患者的治療終點是HBeAg血清學轉換（HBeAg轉化為HBeAb)，並且每6個月檢測1次，連續2次HBVDNA達到不可檢測水平。
關於哪些病人適合抗病毒治療，哪些病人可以暫緩抗病毒治療（抗病毒治療的適應症）的問題，將在以後的文章中加以介紹。
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