癲癇的手術適應症有一定的範圍，並不是所有的癲癇患者都需要進行外科干預，其主要的評估流程包括：
1、確定為頑固性(藥物難治性)癲癇
癲癇患者在2年內正規應用兩種一線抗癲癇藥物治療，每月仍發作一次以上者(特別是全面性強直-陣攣發作)，同時伴有一定的精神心理、認知和行為異常，影像患者日常生活和工作者，可確定為頑固性(藥物難治性)癲癇。兒童的難治性癲癇可早期手術，兒童的腦部處於發育期，越早手術可使癲癇的異常放電對腦發育的影響降低，而且手術所造成的創傷也由於大腦的尚存的可塑性，可使神經組織有較多的機會形成代償而得到最大的功能恢復。
2、選擇適宜外科手術治療的癲癇、癲癇綜合症
①顳葉內側癲癇
伴有海馬硬化的的顳葉內側癲癇是一種癲癇的癲癇綜合症，其臨床表現是難治性複雜部分性發作，其手術療效相當明確。只要腦電圖提示發作起源於一側顳葉，同時MRI提示該側海馬有損傷或SPECT提示該側有血流量改變，就可以進行手術治療。
②伴有病變的侷限性癲癇
腦部的腫瘤、外傷、血管畸形、腦囊蟲等均可有引起癲癇，其手術療效主要取決於致癇灶的病理結果和病變所在部位，低級別的膠質瘤、海綿狀血管畸形等手術手術效果較明顯，但如果病變復發，需要再次手術。
③原發性的侷限性癲癇
某些癲癇沒有明確的導致發病的原發病灶，稱為原發性癲癇。只要其服用藥物治療無效、臨床症狀、MRI和腦電圖至少有兩項結果表明其為侷限性癲癇、病灶位於大腦皮質，就可進行手術治療。
④瀰漫一側大腦半球的癲癇
有些癲癇的致癇灶侷限於一側大腦半球，其症狀重，一般是頑固性的，其發作表現既可以是單側性的，也可以是雙側性的。如果其致癇灶不是位於優勢半球，即使一側半球切除，也不會引用相應的神經功能喪失，而癲癇發作則會消失。其主要包括Rasmussen腦炎、腦面血管瘤病、偏癱性嬰兒癲癇、偏側皮質發育不良、偏側巨腦回等。
總之，早期手術治療頑固性(藥物難治性)癲癇可以使癲癇發作停止，同時避免出現不可逆的神經精神功能障礙。而且由於近幾年影像和電生理技術的發展，同時由於技術的發展使手術治療的有效性和安全性大大提高，只要手術適應症選擇得當、其術後的療效也會很好。因此，手術不再是是癲癇患者最後的選擇。
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