複發性流產是指自然流產2次或以上，也稱習慣性流產。導致複發性流產的原因很多，常常分為以下幾個方面：
第一：遺傳因素。染色體異常原因常見，包括夫妻雙方染色體異常。半數自然流產的胎兒染色體異常。
第二：內分泌因素。黃體功能不全為常見原因。黃體功能不全表現為產生孕激素不足或黃體持續時間不足。糖尿病、多囊卵巢綜合症及子宮內膜異位症病人因內分泌紊亂，流產率高。
第三：解剖因素。宮腔異常，宮頸機能不全均會導致流產。宮腔異常包括子宮畸形、宮腔粘連和粘膜下肌瘤、息肉等。
第四：免疫因素。懷孕需要母嬰免疫相容，正常妊娠是成功的半同種移植。封閉抗體的缺乏及自身抗體(如抗心磷脂抗體、狼瘡抗凝因子、抗精子抗體等)的出現均會導致流產。
第五：自身疾病。多種微生物感染，免疫系統疾病等。
第六：環境因素。電離輻射、不良生活習慣、有毒物質的接觸等。
第七：原因不明。現有醫療水平不能查出原因。
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