許多腰痛、血尿患者一去醫院檢查就診斷出是泌尿繫結石，甚至有些人毫無症狀，是體檢時發現有泌尿繫結石。這些泌尿繫結石患者這時往往很茫然，不知該如何去治療，因為醫生推薦的治療方法往往不一，病人對醫生推薦的治療方法有時也持懷疑態度，到處去打聽，甚至上網去搜索。因此，讓病人知道泌尿繫結石的常規治療方法及適應症，選擇正確的治療方案，就顯得尤為重要。
一般來說，泌尿繫結石有藥物保守治療、體外震波碎石治療、腔鏡微創治療以及傳統手術治療。如果腎結石或輸尿管結石很小，小於6mm，就可以採用藥物保守治療，有很多排石化石的藥物，配合以飲水、運動，結石往往可以排出。如果結石大於6mm，特別是8mm以上的結石，合併有腎積水，就需要採用比較特殊的治療方法了，諸如體外震波碎石治療、腔鏡微創治療、傳統手術治療等。至於採用何種特殊治療，那就要看結石的大小、結石的多少、結石的部位以及有無腎積水等。
體外震波碎石治療是除藥物治療以外對人體損傷最小的一種治療方法，幾乎沒有痛苦，適合於20mm以下的腎結石或輸尿管結石，一般治療1~2次即可，如果仍不能將結石粉碎排出，就不要再做體外震波碎石了，因為體外震波碎石次數太多會損害腎臟。
輸尿管中下段結石最好的治療方法是輸尿管鏡鈥鐳射碎石或輸尿管鏡氣壓彈道碎石，這是一種微創治療方法，損傷小，恢復快，但也要在麻醉下進行，一般住院3~5日即可出院。輸尿管上段的結石除了上述的體外震波碎石之外，也可採用輸尿管鏡鈥鐳射碎石或輸尿管鏡氣壓彈道碎石，但要小心將結石打入腎臟，太靠近腎盂的結石還是採用經皮腎鏡鈥鐳射碎石或腹腔鏡取石術比較好。
腎臟比較大的結石，特別是多髮結石或鑄形結石，就適合採用經皮腎鏡鈥鐳射碎石或經皮腎鏡氣壓彈道碎石，這雖然也是一種微創手術，但需要在腎臟上打一個洞，對腎臟還是有一定的損傷，患者須瞭解這一點。
上述治療方法基本可以解決絕大多數泌尿繫結石問題，只有少數特別複雜的結石，比如合併有泌尿系畸形、泌尿系感染、嚴重腎積水的結石，才可以考慮採用傳統手術治療。
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