只有確診為血清HCV RNA陽性的丙型肝炎患者才需要抗病毒治療。
(1)急性丙型肝炎。IFNα治療能顯著降低急性丙型肝炎的慢性化率，因此，如果檢測到HCV RNA陽性，即應開始抗病毒治療。目前對急性丙型肝炎治療尚無統一方案，建議給予普通IFNα 3MU，隔日1次肌肉或皮下注射，療程為24周，應同時服用利巴韋林800～1000mg/d。
(2)慢性丙型肝炎。①ALT或AST持續或反覆升高，或肝組織學有明顯炎症壞死(G≥2)或中度以上纖維化(S≥2)者，易進展為肝硬化，應給予積極治療。②ALT持續正常者大多數肝臟病變較輕，應根據肝活檢病理學結果決定是否治療。對已有明顯纖維化(S2、S3)者，無論炎症壞死程度如何，均應給予抗病毒治療;對輕微炎症壞死且無明顯纖維化(S0、S1)者，可暫不治療，但每隔3～6個月應檢測肝功能。③ALT水平並不是預測患者對IFNα應答的重要指標。既往曾報道，用普通IFNα治療ALT正常的丙型肝炎患者無明顯效果，因而不主張應用IFNα治療。但最近有研究發現，用PEG-IFNα-2a與利巴韋林聯合治療ALT正常的丙型肝炎患者，其病毒學應答率與ALT升高的丙型肝炎患者相似。因此，對於ALT正常或輕度升高的丙型肝炎患者，只要HCV RNA陽性，也可進行治療，但尚需積累更多病例作進一步研究。
(3)丙型肝炎肝硬化：①代償期肝硬化(Child-Pugh A級)患者，儘管對治療的耐受性和效果有所降低，但為使病情穩定、延緩或阻止肝功能衰竭和HCC等併發症的發生，建議在嚴密觀察下給予抗病毒治療。②失代償期肝硬化患者，多難以耐受IFNα治療的不良反應，有條件者應行肝臟移植術。
(4)肝移植後丙型肝炎復發：HCV相關的肝硬化或HCC患者經肝移植後，HCV感染複發率很高。IFNα治療對此類患者有一定效果，但有促進對移植肝排斥反應的可能，可在有經驗的專科醫生指導和嚴密觀察下進行抗病毒治療。
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